Klinik Örneklerden İzole Edilen Streptococcus Pneumomae Suşlannda Antibiyogram Direnci ve İzolatların Serotiplendirilmesi
Künye
Topal, Muharrem. Klinik Örneklerden İzole Edilen Streptococcus Pneumomae Suşlannda Antibiyogram Direnci ve İzolatların Serotiplendirilmesi. Afyonkarahisar: Afyon Kocatepe Üniversitesi, 2012.Özet
Streptococcus pneumomae, sepsis ve menenjit gibi invaziv bakteriyel enfeksiyonlarının en önemli nedenlerinden biridir. Pnömokoklara karşı güçlü antimikrobiyal tedavi ve aşılar bulunmasına rağmen bu enfeksiyonlardan farklı yaş gruplarında ölüm oranları halen yüksektir. Türkiye'de invaziv enfeksiyonların çoğu serotip 1, 6, 19, ve 23 ile olmakta, izole edilen penisilin dirençli .S. pneumomae suşlannda ise serotip 19, 23, 14 ve 6 sıklıkla gözlenmektedir.
Çalışmada, Nisan 2010 - Kasım 2012 yılları Afyon Kocatepe Üniversitesi Hastanesi Mikrobiyoloji Laboratuarında izole edilen 34 S. pneumomae susunun penisilin ve diğer sık kullanılan antibiyotiklere direnç oranları belirlenmiş ayrıca bu şuşların serotiplendirilmesi yapılmıştır. Suşların identifıkasyonu safrada erime ve optokin duyarlılık testleri ile, serotiplendirilmesi ise kapsül şişme (Quellung) (Pneumotest, Stantens Serum Institut, Denmark) testi kullanılarak gerçekleştirilmiştir. Tüm izolatların penisilin, sefotaksim, seftriakson ve vankomisin MİK değerleri CLSI kriterlerine göre E-test (AB Biodisk, Solna, İsveç) yöntemi ile; tetrasiklin, levofloksasin, klindamisin, oksasilin, ofloksasin, eritromisin, kloramfenikol ve trimetoprim-sulfametoksazola duyarlılık ise disk difüzyon yöntemi ile saptanmıştır. Kalite kontrol susu olarak & pneumomae ATCC 49619 kullanılmıştır. Araştırılan 34 susun 27'si (% 79,4) solunum yolu (balgam, endotrakeal aspirat, bronkoalveoler lavaj), 2'si (% 5,8) konjunktival sürüntü, 3'ü (% 8,8) kan, biri (% 2,9) yara ve biri (% 2,9) BOS örneklerinden izole edilmiş olup, örneklerin 31'i (% 91,1) erişkin hastalara aittir.
İnvaziv 4 izolatın 3'ü (%75), non-invaziv suşların ise (n=30) %10'u penisiline dirençli bulunmuş olup, çalışmamızda yüksek düzey penisilin direnci %17,6 ve orta düzey penisilin direnci %23,5 saptanmıştır. Suşların 16'sının (% 47) ve penisiline dirençli suşların tamamının çoklu ilaca dirençli olduğu belirlenmiştir. S.
61
pneumoniae suşlarında tetrasikline % 5,8 , levofloksasine % 17,6 , klindamisine % 38,2 , trimetoprim-sulfametoksazola %70,5 , entromisine %41,1 , ofloksasine %14,7, seftriaksona %11,7 , sefotaksime %17,6 oranında direnç saptanmıştır. Vankomisine dirençli suş bulunmamıştır.
İzole edilen 34 S. pneumoniae susunun 13'ünde serotip 6 (%38,2) saptanmış olup bunu serotip 23(n=3; % 8,8), serotip 18, serotip 12 ve serotip 14 ikişer suş (%5,8) ile; serotip 5, serotip 19 ve serotip 3 de birer suş ile takip etmiştir. Suşlardan dokuzu pool düzeyinde serotiplendirilmiştir. Penisiline dirençli suşların ise daha çok serotip 6A ve 23 olduğu gözlenmiştir.
Sonuç olarak, antibiyotik sürveyansı ve serotip dağılımının belirlenmesi, ampirik tedavinin şekillenmesi, dirençli serotiplerin takibi ve aşı içeriği uyumu açısından gereklidir. Çalışma bu hali ile bölgemizdeki ilk serotip verilerini içermektedir. S. pneumoniae is one of the most important causes of invasive bacterial infections, including sepsis and meningitis. Despite the availability of potent antimicrobial tlıeıapies and vaccines for pneumococci, infections result in a lıigh mortality rate among several different age groups. in Turkey, serogroups/serotypes 1,6, 19, and 23 cause the nıajority of cases of invasive infections. Similarly, among the penicillin resistant S. pneumoniae isolates in Turkey and the most prevalent serogroups/serotypes are 19, 23, 14 and 6.
in this study, we ainıed to determine the serotypes and resistance status of & pneumoniae strains. This prospective study was conducted between April 2010 and November 2012 in Afyon Kocatepe University Hospital, Microbiology laboratory. The aim of this study was to evaluate the antimicrobial susceptibilities to penicillin and other commonly used agents in 34 isolates recovered from clinical specinıens from children and adults, and to determine the serotypes/serogroups related to resistance. Bile-solubility and opthochin susceptibility tests were conducted to identify the strains. Serotyping was performed by Quellung reaction using Pneumotest (Statens Serum Institut, Copenhagen, Denmark). The minimal inhibitory concentration (MIC) of each isolate to penicillin, cefotaxime, ceftriaxone and vanconıycin was determined using E-test (AB Biodisk, Solna, Sweden) and interpreted according to the Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI) breakpoints. Susceptibility to tetracycline, levofloxacin, clindanıycin, oxacilin, ofloxacin, erythromycin, chloranıphenicol, and trimethoprim-sulfamethoxasole was determined using the disk-diffusion metlıod and was similarly interpreted following CLSI criteria. S. pneumoniae ATCC 49619 vvas used as the quality control strain for antimicrobial susceptibility testing.Of the 34 strains identifıed, 27 (79,4%) were from respiratory tract, 2 (5,8%) isolates were from conjunctival swab, 3 (8,8%) were from
63
blood, 1 (2,9%) was from wound and 1(%2,9) was from cerebrospinal flııid. 31 (%91,1) strains isolated from adult events.
A total of 34 strains, 6 (17,6%), penicillin-resistant, 8 (23,5%), moderately susceptible, and 20 (58,9%) were sıısceptible. Invasive 3 of the 4 strains fouııd resistant and 1 strain was suspectiple. Non-invasive strains, 3 of 30 (10%), penicillin-resistant, and 8 (26,6%) moderately susceptible to penicillin, and 19 (63,3%) were susceptible. 16 of 34 strains (47%) and ali of penicillin-resistant strains were multiple dmg resistant. 5,8% of S. pneumoniae strains fouııd resistant to tetracycline, 17,6% to levofloxacin, 38,2% to clindanıycin, 70,5% to trinıethoprim-sulfametlıoxasole, 38,2% to oxacilin, 41,1% to erythromycin, 14,7% to ofloxacin, 11,7% to ceftriaxone, %17,6 to cefotaxime. There is no strain fouııd resistant to vancomycin.
The majority (n = 13; %38,2) belonged to serotype 6, followed by 23( n = 3;% 8,8). 2 strains of each serotype 18, 12 and 14, one strain of each serotype 5, 9 and 3 observed. 9 strains were serotyped pool level. Penicillin resistants strains were mostly from serotype 6A and 23.
As a result, detemıination of antibiotic surveillance and serotype distribution is required for formation of the empirical treatment of resistant serotypes follow-up and compliaııce with the contents of the vaccine. Study vvitlı this situation, includes fırst data about the serotypes in our region.
Bağlantı
http://hdl.handle.net/11630/2239Koleksiyonlar
- Yüksek Lisans Tezleri [635]